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circRNA整體解決方案
來源: | 作者:1 | 發(fā)布時間: 1751天前 | 1856 次瀏覽 | 分享到:
環(huán)狀RNA（circRNA）是一類特殊的非編碼RNA分子（在活體中有時也有表達），是RNA領(lǐng)域*新的研究熱點。與傳統(tǒng)的線性RNA（linear，含5’和3’末端）不同，circRNA分子呈閉環(huán)結(jié)構(gòu)，不受RNA外切酶影響，表達更穩(wěn)定，不易降解。在功能上，今年的研究表明，circRNA分子富含microRNA（miRNA）結(jié)合位點，在細(xì)胞中起到miRNA海綿（miRNA sponge）的作用，進而解除miRNA對其靶基因的抑制作用，升高靶基因的表達水平，這一作用機制被稱為競爭性內(nèi)源（ceRNA機制）。通過與疾病關(guān)聯(lián)的miRNA相互作用，circRNA在疾病中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。

特征與功能：

環(huán)狀RNA（circRNA）是一類特殊的非編碼RNA分子（在活體中有時也有表達），是RNA領(lǐng)域*新的研究熱點。與傳統(tǒng)的線性RNA（linear，含5’和3’末端）不同，circRNA分子呈閉環(huán)結(jié)構(gòu)，不受RNA外切酶影響，表達更穩(wěn)定，不易降解。在功能上，今年的研究表明，circRNA分子富含microRNA（miRNA）結(jié)合位點，在細(xì)胞中起到miRNA海綿（miRNA sponge）的作用，進而解除miRNA對其靶基因的抑制作用，升高靶基因的表達水平，這一作用機制被稱為競爭性內(nèi)源（ceRNA機制）。通過與疾病關(guān)聯(lián)的miRNA相互作用，circRNA在疾病中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。

成環(huán)機制：
circRNA環(huán)化方式分為內(nèi)含子環(huán)化和外顯子環(huán)化，目前主流的成環(huán)機制可歸類成三種：
1.依賴于剪切體的索尾插接環(huán)化；
2.順式作用元件促進circRNA形成；
3.RNA結(jié)合蛋白（RBPs）調(diào)控cicRNA形成。

生物學(xué)功能：
circRNA主要存在于細(xì)胞質(zhì)或外泌體中，具有組織特異性、疾病特異性、時序特異性及高穩(wěn)定性等特征。近幾年，大量的研究表明circRNA在生物的生長發(fā)育、脅迫應(yīng)答、疾病發(fā)生和發(fā)展等方面密切相關(guān)，并預(yù)測其在疾病診斷標(biāo)記物等方面的應(yīng)用前景，但其生物學(xué)功能在很大程度上仍然未知。目前認(rèn)可度比較高的circRNA生物學(xué)功能，歸類如下：
1.miRNA sponge。circRNA富含miRNA結(jié)合位點來充當(dāng)miRNA海綿作用，阻止miRNA在3’UTR與mRNA相互作用，進而間接調(diào)控miRNA下游靶基因的表達；
2.調(diào)控蛋白結(jié)合。cicRNA通過與mRNA調(diào)節(jié)的結(jié)合蛋白（RBP）結(jié)合，進而改變剪接模式或mRNA穩(wěn)定性；
3.調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄。circRNA與RNA聚合酶相互作用并調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄，或者circRNA可與小核糖核蛋白相互作用，再與RNA聚合酶結(jié)合；
4.編碼功能。circRNA雖然屬于非編碼RNA，但也有部分circRNA可被核糖體翻譯并編碼多肽，進而行使調(diào)控功能。



circRNA研究思路：



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臨床標(biāo)本，例如腫瘤組織、癌旁組織和正常組織等。




  
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