circRNA整體解決方案
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環(huán)狀RNA(circRNA)是一類特殊的非編碼RNA分子(在活體中有時也有表達),是RNA領域*新的研究熱點。與傳統(tǒng)的線性RNA(linear,含5’和3’末端)不同,circRNA分子呈閉環(huán)結構,不受RNA外切酶影響,表達更穩(wěn)定,不易降解。在功能上,今年的研究表明,circRNA分子富含microRNA(miRNA)結合位點,在細胞中起到miRNA海綿(miRNA sponge)的作用,進而解除miRNA對其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表達水平,這一作用機制被稱為競爭性內(nèi)源(ceRNA機制)。通過與疾病關聯(lián)的miRNA相互作用,circRNA在疾病中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。
特征與功能:
環(huán)狀RNA(circRNA)是一類特殊的非編碼RNA分子(在活體中有時也有表達),是RNA領域*新的研究熱點。與傳統(tǒng)的線性RNA(linear,含5’和3’末端)不同,circRNA分子呈閉環(huán)結構,不受RNA外切酶影響,表達更穩(wěn)定,不易降解。在功能上,今年的研究表明,circRNA分子富含microRNA(miRNA)結合位點,在細胞中起到miRNA海綿(miRNA sponge)的作用,進而解除miRNA對其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表達水平,這一作用機制被稱為競爭性內(nèi)源(ceRNA機制)。通過與疾病關聯(lián)的miRNA相互作用,circRNA在疾病中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。
成環(huán)機制:
circRNA環(huán)化方式分為內(nèi)含子環(huán)化和外顯子環(huán)化,目前主流的成環(huán)機制可歸類成三種:
1.依賴于剪切體的索尾插接環(huán)化;
2.順式作用元件促進circRNA形成;
3.RNA結合蛋白(RBPs)調(diào)控cicRNA形成。
生物學功能:
circRNA主要存在于細胞質或外泌體中,具有組織特異性、疾病特異性、時序特異性及高穩(wěn)定性等特征。近幾年,大量的研究表明circRNA在生物的生長發(fā)育、脅迫應答、疾病發(fā)生和發(fā)展等方面密切相關,并預測其在疾病診斷標記物等方面的應用前景,但其生物學功能在很大程度上仍然未知。目前認可度比較高的circRNA生物學功能,歸類如下:
1.miRNA sponge。circRNA富含miRNA結合位點來充當miRNA海綿作用,阻止miRNA在3’UTR與mRNA相互作用,進而間接調(diào)控miRNA下游靶基因的表達;
2.調(diào)控蛋白結合。cicRNA通過與mRNA調(diào)節(jié)的結合蛋白(RBP)結合,進而改變剪接模式或mRNA穩(wěn)定性;
3.調(diào)控基因轉錄。circRNA與RNA聚合酶相互作用并調(diào)節(jié)轉錄,或者circRNA可與小核糖核蛋白相互作用,再與RNA聚合酶結合;
4.編碼功能。circRNA雖然屬于非編碼RNA,但也有部分circRNA可被核糖體翻譯并編碼多肽,進而行使調(diào)控功能。
circRNA研究思路:
客戶提供:
臨床標本,例如腫瘤組織、癌旁組織和正常組織等。