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circRNA整體解決方案
來(lái)源: | 作者:1 | 發(fā)布時(shí)間: 1755天前 | 1871 次瀏覽 | 分享到:
環(huán)狀RNA(circRNA)是一類特殊的非編碼RNA分子(在活體中有時(shí)也有表達(dá)),是RNA領(lǐng)域*新的研究熱點(diǎn)。與傳統(tǒng)的線性RNA(linear,含5’和3’末端)不同,circRNA分子呈閉環(huán)結(jié)構(gòu),不受RNA外切酶影響,表達(dá)更穩(wěn)定,不易降解。在功能上,今年的研究表明,circRNA分子富含microRNA(miRNA)結(jié)合位點(diǎn),在細(xì)胞中起到miRNA海綿(miRNA sponge)的作用,進(jìn)而解除miRNA對(duì)其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表達(dá)水平,這一作用機(jī)制被稱為競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源(ceRNA機(jī)制)。通過與疾病關(guān)聯(lián)的miRNA相互作用,circRNA在疾病中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。

特征與功能:

環(huán)狀RNA(circRNA)是一類特殊的非編碼RNA分子(在活體中有時(shí)也有表達(dá)),是RNA領(lǐng)域*新的研究熱點(diǎn)。與傳統(tǒng)的線性RNA(linear,含5’和3’末端)不同,circRNA分子呈閉環(huán)結(jié)構(gòu),不受RNA外切酶影響,表達(dá)更穩(wěn)定,不易降解。在功能上,今年的研究表明,circRNA分子富含microRNA(miRNA)結(jié)合位點(diǎn),在細(xì)胞中起到miRNA海綿(miRNA sponge)的作用,進(jìn)而解除miRNA對(duì)其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表達(dá)水平,這一作用機(jī)制被稱為競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源(ceRNA機(jī)制)。通過與疾病關(guān)聯(lián)的miRNA相互作用,circRNA在疾病中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。

成環(huán)機(jī)制:
circRNA環(huán)化方式分為內(nèi)含子環(huán)化和外顯子環(huán)化,目前主流的成環(huán)機(jī)制可歸類成三種:
1.依賴于剪切體的索尾插接環(huán)化;
2.順式作用元件促進(jìn)circRNA形成;
3.RNA結(jié)合蛋白(RBPs)調(diào)控cicRNA形成。

生物學(xué)功能:
circRNA主要存在于細(xì)胞質(zhì)或外泌體中,具有組織特異性、疾病特異性、時(shí)序特異性及高穩(wěn)定性等特征。近幾年,大量的研究表明circRNA在生物的生長(zhǎng)發(fā)育、脅迫應(yīng)答、疾病發(fā)生和發(fā)展等方面密切相關(guān),并預(yù)測(cè)其在疾病診斷標(biāo)記物等方面的應(yīng)用前景,但其生物學(xué)功能在很大程度上仍然未知。目前認(rèn)可度比較高的circRNA生物學(xué)功能,歸類如下:
1.miRNA sponge。circRNA富含miRNA結(jié)合位點(diǎn)來(lái)充當(dāng)miRNA海綿作用,阻止miRNA在3’UTR與mRNA相互作用,進(jìn)而間接調(diào)控miRNA下游靶基因的表達(dá);
2.調(diào)控蛋白結(jié)合。cicRNA通過與mRNA調(diào)節(jié)的結(jié)合蛋白(RBP)結(jié)合,進(jìn)而改變剪接模式或mRNA穩(wěn)定性;
3.調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄。circRNA與RNA聚合酶相互作用并調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄,或者circRNA可與小核糖核蛋白相互作用,再與RNA聚合酶結(jié)合;
4.編碼功能。circRNA雖然屬于非編碼RNA,但也有部分circRNA可被核糖體翻譯并編碼多肽,進(jìn)而行使調(diào)控功能。



circRNA研究思路:



客戶提供:
臨床標(biāo)本,例如腫瘤組織、癌旁組織和正常組織等。




  
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